Oaxaca Emprende opera de manera colegiada, todos sus representantes cuentan con voz en diferentes ámbitos.
Comité Rectoral.
Conformado por los 11 Rectores y Directores de las Instituciones de Educación Superior participantes y el Presidente de la Fundación Multiplicación de Oportunidades. El Comité Rectoral, toma las decisiones trascendentales del concurso, desde la apertura de la convocatoria hasta la ceremonia de premiación; y posterior a ésta, el seguimiento de proyectos ganadores. Es decir es el máximo órgano en la toma de decisiones del proyecto.
Comité Ético.
Está conformado por integrantes del Comité Colegiado y la Fundación, se hace responsable de la decisiones éticas sobre el comportamiento de los estudiantes y de sus proyectos; aclara los lineamientos para participar y competir en el concurso; propone los lineamientos operativos y el manual de administración del Comité Colegiado al Comité Rectoral para su aprobación; determina la estadía o no de los proyectos que pasan a la fase final y verifica las probables faltas cometidas.
Comité Colegiado Interuniversitario.
Es un órgano operativo conformado por los coordinadores de las 11 instituciones participantes y la Fundación Multiplicación de Oportunidades.
El Comité, toma las decisiones operativas, analiza, propone, planea y ejecuta, el programa de trabajo del Concurso, con el objetivo de lograr la mejor experiencia posible para los estudiantes; asimismo, aclara los lineamientos operativos con base en la experiencia de los estudiantes al aplicar su plan de negocios en la creación de su empresa, y da seguimiento a los proyectos ganadores a nivel operativo.
La Fundación Multiplicación de Oportunidades con el apoyo del Comité Colegiado, solicita los documentos que comprueben el gasto de los premios otorgados en capital semilla a los estudiantes; genera los reportes trimestrales y anuales para informar al Consejo de Rectores sobre la aplicación de los recursos financieros, tanto de las universidades participantes como de los patrocinadores del Concurso.
